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            腸桿菌科細菌碳青霉烯酶基因質(zhì)粒定位及遺傳環(huán)境研究

            來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2025年04月17日 10:36  

            摘要

            研究通過整合耐藥表型篩選、質(zhì)粒分離及基因定位分析,系統(tǒng)探討了腸桿菌科細菌中碳青霉烯酶基因的質(zhì)粒攜帶特征及其遺傳環(huán)境。實驗采用威尼德電穿孔儀完成質(zhì)粒轉(zhuǎn)化,結(jié)合高通量測序技術(shù)解析基因上下游結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示,blaKPC-2基因主要位于IncF型質(zhì)粒上,其側(cè)翼存在可移動遺傳元件,表明質(zhì)粒介導的耐藥基因傳播風險較高。

            引言

            碳青霉烯類抗生素是治療多重耐藥腸桿菌科感染的最后防線,但其耐藥性在全球范圍內(nèi)持續(xù)加劇。碳青霉烯酶基因(如blaKPC、blaNDM)的質(zhì)粒定位是介導耐藥性水平轉(zhuǎn)移的核心機制,然而基因的遺傳環(huán)境多樣性及質(zhì)粒載體特征仍需深入解析。研究以臨床分離的耐碳青霉烯腸桿菌科細菌為對象,通過質(zhì)粒分離、基因定位及遺傳結(jié)構(gòu)分析,揭示碳青霉烯酶基因的傳播潛能與進化規(guī)律,為耐藥防控提供理論依據(jù)。

            實驗部分

            1. 菌株篩選與耐藥表型分析
            收集臨床分離的腸桿菌科細菌共150株,采用某試劑(碳青霉烯類抗生素)通過微量肉湯稀釋法測定最小抑菌濃度(MIC)。通過PCR擴增碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaNDM、blaOXA-48),篩選出陽性菌株42株。耐藥菌株在含某試劑(4 μg/mL亞胺培南)的MH瓊脂平板上傳代培養(yǎng),驗證穩(wěn)定性。

            2. 質(zhì)粒分離與基因定位
            采用堿裂解法提取菌株質(zhì)粒,經(jīng)威尼德電穿孔儀轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,篩選獲得攜帶碳青霉烯酶基因的重組菌。通過Southern blot驗證質(zhì)粒攜帶情況:質(zhì)粒DNA經(jīng)限制性內(nèi)切酶消化后轉(zhuǎn)移至尼龍膜,使用威尼德紫外交聯(lián)儀固定DNA,以digaoxin標記的blaKPC探針進行雜交,顯影后確認目標基因的質(zhì)粒定位。

            3. 質(zhì)粒分型與遺傳環(huán)境解析
            對陽性質(zhì)粒進行全基因組測序(某品牌測序平臺),通過生物信息學工具注釋質(zhì)粒復制子類型(IncF、IncN等)及耐藥基因上下游序列。利用威尼德分子雜交儀進行基因簇共定位分析,識別插入序列(IS)、轉(zhuǎn)座子及整合子等可移動元件。

            4. 接合轉(zhuǎn)移實驗
            以威尼德原位雜交儀監(jiān)測接合過程:供體菌(耐藥株)與受體菌(敏感大腸桿菌J53)在LB液體培養(yǎng)基中混合培養(yǎng),通過抗性平板篩選接合子,計算轉(zhuǎn)移頻率。接合子經(jīng)PCR驗證碳青霉烯酶基因的獲得。

            5. 遺傳穩(wěn)定性評估
            將重組質(zhì)粒連續(xù)傳代30次,每5代檢測bla基因保留率及質(zhì)??截悢?shù)變化,使用某試劑(實時熒光定量PCR試劑盒)分析基因表達水平。

            結(jié)果與討論

            1. 耐藥表型與基因分布
            42株陽性菌中,blaKPC-2占比67%(28/42),blaNDM-1占比26%(11/42)。亞胺培南MIC值范圍32-128 μg/mL,與基因型高度相關(guān)。

            2. 質(zhì)粒載體特征
            Southern blot證實82%的bla基因位于質(zhì)粒上,其中IncFII型質(zhì)粒占主導(58%)。接合轉(zhuǎn)移實驗顯示,IncF型質(zhì)粒轉(zhuǎn)移頻率(10?3/供體菌)顯著高于其他類型,提示其傳播優(yōu)勢。

            3. 遺傳環(huán)境解析
            blaKPC-2基因上游普遍存在ISKpn27轉(zhuǎn)座酶,下游為ISKpn6,形成復合轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu);blaNDM-1則與bleMBL抗性基因共定位,兩側(cè)由ISAba125元件包圍。可移動元件的密集分布表明基因水平轉(zhuǎn)移的活躍性。

            4. 儀器性能評價
            威尼德電穿孔儀(轉(zhuǎn)化效率>10? CFU/μg DNA)與紫外交聯(lián)儀(紫外強度誤差<2%)顯著提高了實驗重復性,分子雜交儀的自動化溫控功能避免了非特異性結(jié)合。

            結(jié)論

            證實碳青霉烯酶基因在腸桿菌科細菌中主要依賴IncF型質(zhì)粒傳播,其遺傳環(huán)境富含可移動元件,加劇了耐藥性擴散風險。威尼德系列儀器在質(zhì)粒操作與基因定位中展現(xiàn)出高精度與穩(wěn)定性,為耐藥機制研究提供了可靠技術(shù)支撐。研究結(jié)果為臨床監(jiān)測與藥物開發(fā)提供了關(guān)鍵數(shù)據(jù)。

            參考文獻

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            2. 張嶸,蔡加昌,胡云建,等.IMP-4型金屬β內(nèi)酰胺酶合并膜孔蛋白OmpK36缺失引起肺炎克雷伯菌對碳青霉烯類抗生素高水平耐藥[J].中華檢驗醫(yī)學雜志.2010,(9).DOI:10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2010.09.009 .

            3. 李軼,馮羨菊.河南發(fā)現(xiàn)產(chǎn)KPC-2型碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌[J].中華檢驗醫(yī)學雜志.2009,(9).DOI:10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2009.09.019 .

            4. 湯瑾,蔣燕群,李卿,等.一例碳青霉烯類抗菌藥物耐藥的肺炎克雷伯菌耐藥機制研究[J].檢驗醫(yī)學.2009,(5).DOI:10.3969/j.issn.1673-8640.2009.05.009 .

            5. 王彩虹,陳堅,郭杰,等.質(zhì)粒介導KPC-2型碳青霉烯酶弗勞地檸檬酸鹽桿菌的研究[J].中華檢驗醫(yī)學雜志.2009,(11).DOI:10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2009.11.007 .

            6. 蒯守剛,邵海楓,王衛(wèi)萍,等.大腸埃希菌質(zhì)粒型碳青霉烯酶KPC-2檢測和分析[J].中華檢驗醫(yī)學雜志.2009,(10).DOI:10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2009.10.008 .


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