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            RNA連接酶再上新!T4 RNA Ligase 2截短型,small RNA建庫(kù)研究工具

            來(lái)源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2025年04月24日 13:06  

            在高通量測(cè)序技術(shù)日新月異的當(dāng)下,small RNA(涵蓋 miRNA、siRNA、piRNA 等)研究已然成為探索生命調(diào)控奧秘的關(guān)鍵領(lǐng)域。而基于T4 RNA連接酶的建庫(kù)技術(shù),作為small RNA研究的核心環(huán)節(jié),卻長(zhǎng)期受兩大技術(shù)難題困擾

            ①連接效率欠佳:傳統(tǒng)T4 RNA連接酶對(duì)短鏈RNA適配性不足,極易產(chǎn)生接頭自連等副產(chǎn)物,致使文庫(kù)出現(xiàn)嚴(yán)重偏好性;

            ②末端偏好性顯著:普通酶易受RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)或末端修飾影響,從而導(dǎo)致數(shù)據(jù)偏差。

             

            圖1.傳統(tǒng)T4 RNA連接酶在small RNA建庫(kù)中的應(yīng)用流程示意圖[1]

             

            如今,T4 RNA連接酶2截短型(T4 RNA Ligase 2, truncated,T4 Rnl2tr)的問(wèn)世,改寫(xiě)了small RNA建庫(kù)技術(shù)格局。該酶能夠特異性催化5′端預(yù)腺苷化的DNA/RNA與RNA 3′-OH末端的連接反應(yīng)。其在于無(wú)需ATP參與,不過(guò)必須搭配5′端預(yù)腺苷化接頭使用。當(dāng)它與T4 RNA ligase 1協(xié)同運(yùn)作時(shí),可實(shí)現(xiàn)打斷RNA的直接接頭連接,有效遏制接頭串聯(lián)和自連現(xiàn)象,大幅提升測(cè)序文庫(kù)的構(gòu)建質(zhì)量。

             

            圖2.T4 Rnl2tr聯(lián)合T4 RNA ligase 1在small RNA建庫(kù)中的應(yīng)用流程示意圖[2]

             

            在此,我們向您推介翌圣生物全新研發(fā)的T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ(Cat#14653)。這款酶作為T(mén)4 Rnl2tr的雙點(diǎn)突變體(R55K, K227Q),在保持高效連接活性的同時(shí),極大程度降低了RNA的非特異性連接問(wèn)題,諸如 RNA 串聯(lián)或自連成環(huán)等情況,堪稱small RNA 3'端接頭連接和cDNA文庫(kù)構(gòu)建的選擇。

             

            目前,翌圣生物已成功構(gòu)建起完備的T4 RNA連接酶產(chǎn)品矩陣,包括T4 RNA ligase 1、T4 RNA ligase 2和T4 RNA ligase 2, truncated KQ,滿足您多樣化的科研需求。其特點(diǎn)及應(yīng)用見(jiàn)下表:

             

             

             

            性能展示

             

            翌圣T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ(Cat#14653)

             

            切割活性,媲美進(jìn)口品質(zhì)

            使用翌圣和來(lái)自進(jìn)口Supplier A*的T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ分別按照不同投入量加入體系中對(duì)31 nt的ssRNA底物(Substrate 1)和17 nt預(yù)腺苷化的ssRNA底物(Substrate 2)進(jìn)行連接實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,翌圣產(chǎn)品能高效連接 ssRNA 底物,連接效果與進(jìn)口產(chǎn)品不相上下。

             

            圖3.T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ連接效果驗(yàn)證

             


             

            無(wú)核酸外切酶、切口酶、RNase酶殘留

            將200 U T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ分別與核酸底物孵育,并通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳分析譜帶變化。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,翌圣的3個(gè)批次T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ均未檢測(cè)出核酸外切酶、切口酶或RNase 殘留,為您的實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性與可靠性保駕護(hù)航。

            圖4.T4 RNA Ligase 2, Truncated KQ核酸外切酶、切口酶、RNase殘留檢測(cè)結(jié)果

             

             

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            活動(dòng)細(xì)則:

            1、活動(dòng)時(shí)間:即日起-5月15日;

            2、活動(dòng)名額有限,每位客戶限一套。

             

             

             

            參考文獻(xiàn):

            [1] Raabe C A , Thean-Hock T , Juergen B ,et al.Biases in small RNA deep sequencing data[J].Nucleic Acids Research, 2014(3):1414-1426.DOI:10.1093/nar/gkt1021.

            [2] Sorefan K , Pais H , Hall A E ,et al.Reducing ligation bias of small RNAs in libraries for next generation sequencing[J].Silence, 2012, 3(1):4-4.DOI:10.1186/1758-907X-3-4.



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