以下是賽默飛熒光定量PCR儀(以QuantStudio 5為例)的操作指南,包括詳細(xì)步驟、實(shí)用技巧以及使用過程中的注意事項(xiàng),旨在幫助用戶規(guī)范使用流程,提升實(shí)驗(yàn)效率與數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性。
一、實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備階段
1. 儀器檢查
2. 耗材準(zhǔn)備
二、實(shí)驗(yàn)步驟
步驟一:反應(yīng)體系配置
配置原則:
常見反應(yīng)體系(20μL)示例:
成分 | 體積(μL) |
---|
2× Master Mix | 10 |
上游引物(10μM) | 0.8 |
下游引物(10μM) | 0.8 |
探針或染料 | 根據(jù)說明書 |
模板DNA/cDNA | 2 |
無核酸酶水 | 補(bǔ)足至20 |
步驟二:樣本加載
使用多道移液器將反應(yīng)體系均勻分裝到PCR板中;
避免氣泡產(chǎn)生,可輕輕離心板子消除氣泡;
使用光學(xué)封板膜密封,確保密封性和光學(xué)透明性;
標(biāo)記板子邊角,便于后續(xù)在軟件中定位樣本孔。
步驟三:加載PCR板并設(shè)置程序
打開儀器上蓋,將樣品放入樣品槽中;
合上上蓋(帶加熱蓋);
在QuantStudio軟件中:
mathematica復(fù)制代碼初始變性:95°C,2分鐘 PCR循環(huán):95°C 15秒 → 60°C 1分鐘,40個(gè)循環(huán) (如需熔解曲線,添加最后一步)
點(diǎn)擊“Start Run”啟動(dòng)實(shí)驗(yàn)。
三、實(shí)驗(yàn)后數(shù)據(jù)處理
1. 實(shí)時(shí)監(jiān)控
實(shí)驗(yàn)過程中可實(shí)時(shí)查看熒光曲線;確認(rèn)每個(gè)樣本擴(kuò)增是否符合預(yù)期(有無拖尾、遲滯、漂移等異常)。
2. 數(shù)據(jù)分析
四、實(shí)用技巧
項(xiàng)目 | 技巧建議 |
---|
引物設(shè)計(jì) | 優(yōu)先使用已驗(yàn)證引物,避免二聚體或非特異性擴(kuò)增;退火溫度差控制在1~2°C |
多重反應(yīng) | 各探針染料避免熒光光譜重疊;使用不同通道分辨;優(yōu)化反應(yīng)條件防止競爭反應(yīng) |
模板質(zhì)量 | RNA需高質(zhì)量,避免降解;建議使用柱式提取、測OD260/280比值確認(rèn)純度 |
板子離心 | 裝板后輕離心,去除氣泡,避免光路干擾 |
實(shí)驗(yàn)重復(fù) | 至少設(shè)置技術(shù)重復(fù)3次,確保統(tǒng)計(jì)意義 |
五、注意事項(xiàng)
操作方面
所有試劑應(yīng)現(xiàn)配現(xiàn)用,并于冰上操作;
每次使用前檢查儀器光學(xué)系統(tǒng)及樣本槽是否干凈;
加熱蓋溫度建議比退火/延伸溫度高5°C,以防蒸發(fā)。
軟件使用
正確設(shè)置每個(gè)孔的熒光染料通道和樣本分組;
使用模板保存實(shí)驗(yàn)設(shè)置,減少重復(fù)錄入;
實(shí)驗(yàn)結(jié)束及時(shí)保存原始文件以備追蹤。
儀器維護(hù)
六、小結(jié)
賽默飛QuantStudio 5熒光定量PCR儀憑借穩(wěn)定的性能和便捷的操作,在各類分子生物實(shí)驗(yàn)中發(fā)揮了重要作用。通過規(guī)范的操作流程、優(yōu)化的實(shí)驗(yàn)設(shè)置和細(xì)致的維護(hù)管理,用戶可以獲得準(zhǔn)確、穩(wěn)定、重復(fù)性良好的檢測結(jié)果。掌握操作技巧和注意事項(xiàng),不僅能提升實(shí)驗(yàn)效率,也有助于減少實(shí)驗(yàn)失敗和數(shù)據(jù)偏差。對于長期開展qPCR實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)室,建立標(biāo)準(zhǔn)操作流程(SOP)尤為重要。