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描述

SEQuoia RiboDepletion 核糖體 RNA 去除試劑盒是一個(gè)通用型試劑盒，可從 RNA-Seq 文庫(kù)中去除來(lái)自細(xì)胞質(zhì)核糖體 RNA（rRNA）和線粒體核糖體 RNA（mt rRNA）片段。核糖體 RNA 豐富，占總 RNA 的 80–90%。有效去除 rRNA 對(duì)于實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)高效的 RNA 樣品測(cè)序至關(guān)重要。

在建庫(kù)前從總 RNA 中去除 rRNA 可能會(huì)導(dǎo)致稀有或低豐度轉(zhuǎn)錄本的丟失。SEQuoia RiboDepletion 核糖體 RNA 去除試劑盒可以去除 RNA-Seq 文庫(kù)中 rRNA 生成的 cDNA 文庫(kù)片段，在剖析整個(gè)轉(zhuǎn)錄組、保留和捕獲小 RNA 方面表現(xiàn)出的性能，同時(shí)限度地減少稀有轉(zhuǎn)錄本和來(lái)自微量或降解樣品的 RNA 的損失。這款通用型的核糖體 RNA 去除試劑盒經(jīng)過(guò)優(yōu)化，可適用于廣泛的輸入范圍（0.1-20 ng 的 RNA-Seq文庫(kù)），并與大多數(shù)商品化的文庫(kù)構(gòu)建試劑盒兼容。通過(guò)創(chuàng)新的庫(kù)后耗竭技術(shù)，可以將多個(gè)帶標(biāo)簽引文庫(kù)混樣處理，在一次反應(yīng)中進(jìn)行 rRNA 去除，限度地提高去除率，節(jié)省大量時(shí)間和成本。

簡(jiǎn)化的工作流程可以在 2 小時(shí)內(nèi)完成。

功能和優(yōu)點(diǎn)

• 從 RNA-Seq 庫(kù)中有效去除核糖體和線粒體 RNA 片段
• 保留通常因前庫(kù) RNA 消耗策略而丟失的稀有轉(zhuǎn)錄本
• 將條形碼庫(kù)合并為一種耗竭反應(yīng)以節(jié)省時(shí)間和金錢

應(yīng)用與用途

SEQuoia RiboDepletion 核糖體 RNA 去除試劑盒中采用的建庫(kù)后去處的策略非常適合研究人員

• 處理微量或降解的樣品
• 針對(duì)稀有轉(zhuǎn)錄本
• 生成更能代表完整轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序數(shù)據(jù)

包含的組件

每個(gè)試劑盒都帶有兩個(gè)試劑盒子。盒子 A 包括用于 cDNA 雜交、去除和擴(kuò)增的試劑；儲(chǔ)存于
–20oC。盒子 B 包括純化磁珠；儲(chǔ)存于 4oC。