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            上海嘉鵬

            主營產品: 超微量分光光度計,核酸蛋白檢測儀,超微量紫外分光光度計,nano光度計,超微量核酸蛋白檢測儀

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            PCR引物設計原則簡介

            2016-3-8 閱讀(3106)

            實驗步驟

            首先引物與模板的序列要緊密互補,其次引物不能在模板的非目的位點引發(fā)DNA 聚合反應(即錯配) ,再次引物與引物之間避免形成穩(wěn)定的二聚體或發(fā)夾結構。引物設計應注意如下要點:

            1.引物的長度一般為15-30 bp,常用的是18-27 bp。

            2.引物序列在模板內應當沒有相似性較高,尤其是3’端相似性較高的序列,否則容易導致錯配。引物3’端出現3 個以上的連續(xù)堿基,如GGG 或CCC,也會使錯誤引發(fā)機率增加。

            3.引物3’端的末位堿基對Taq 酶的DNA 合成效率有較大的影響。不同的末位堿基在錯配位置導致不同的擴增效率,末位堿基為A 的錯配效率明顯高于其他3個堿基,因此應當避免在引物的3’端使用堿基A。

            4.引物序列的GC 含量一般為40-60%,過高或過低都不利于引發(fā)反應。上下游引物的GC含量不能相差太大。

            5.引物的另一個重要參數是熔解溫度(Tm)。這是當50%的引物和互補序列表現為雙鏈DNA分子時的溫度。合理的退火溫度從55℃到70℃。為獲得*結果,兩個引物應具有近似的Tm值。
             

            6.引物二聚體或發(fā)夾結構也可能導致PCR 反應失敗。應該盡量避免。

              上海嘉鵬科技有限公司專業(yè)生產:紫外分析儀、三用紫外分析儀、暗箱式紫外分析儀、暗箱三用紫外分析儀、暗箱紫外分析儀、手提式紫外分析儀、三用紫外分析儀暗箱式、紫外檢測儀、部分收集器、恒流泵、蠕動泵、凝膠成像系統(tǒng)、凝膠成像分析系統(tǒng)、化學發(fā)光成像分析系統(tǒng)、光化學反應儀、旋渦混合器、漩渦混合器、玻璃層析柱、梯度混合器、梯度混合儀、核酸蛋白檢測儀、玻璃層析柱、熒光增白劑測定儀、餾分收集器、切膠儀、藍光切膠儀、層析系統(tǒng)等產品。咨詢。



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