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            技術文章

            豬輪狀病毒PCR檢測試劑盒說明書

            閱讀:90          發(fā)布時間:2025-4-17



            豬輪狀病毒PCR檢測試劑盒說明書

             

            【產(chǎn)品名稱】

              通用名稱:豬輪狀病毒PCR檢測試劑盒(實時熒光PCR法)

              英文名稱Porcine Rotavirus Detection Kit (Real-Time PCR Method)

            【包裝規(guī)格】25T/& 50T/

            【預期用途】

            本試劑盒利用實時熒光PCR原理,定性檢測輪狀病毒,對輪狀病毒引起的胃腸炎及其并發(fā)癥的診斷及療效評估有重要指導意義。

            【檢驗原理】

            本試劑盒針豬輪狀病毒組高度保守區(qū)域設計特異性引物和探針,在反應體系中含豬輪狀病毒模板的情況下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用儀器對PCR過程中相應通道的信號強度進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結果的定性分析。

            【主要組成成份】

            序號

            組成

            25T/

            50T/

            1

            PRV  RT-PCR反應液

            375 μL×1

            750 μL×1

            2

            PRV轉(zhuǎn)錄酶

             50 μL×1

            100 μL×1

            3

            PRV Taq

             75 μL×1

            150 μL×1

            4

            PRV性對照

             40 μL×1

             40 μL×1

            5

            PRV陰性對照

             40 μL×1

             40 μL×1

            6

            說明書

            1

            1

            注:陰性對照為基因組DNA,陽性對照為失去活性的PRV cDNA

            【儲存條件及有效期】避光-20以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。

            【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列 、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCyclerRotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實時熒光定量PCR儀。

            【樣本要求】

            1.采集時間:采集患兒發(fā)病3日內(nèi)或入院24小時,且未服藥之前的糞便標本。

            2.采集方法

             自然排便采集法:自然排便后,收集糞便標本每份510g左右;應放置在無菌容器中,貼上帶有wei識別碼的標簽;

             直腸拭子法:對難以獲得糞便或排便困難的患者及嬰幼兒,可采用直腸拭子法采集標本,標本采集完后插入無菌試管待檢;

            3.應避免標本間交叉污染;

            4.標本采集完畢后若不能立即檢測,可放置于-20的冰箱中保存,避免標本反復凍融。

            【檢驗方法】

            1. 試劑準備(試劑準備區(qū))

            1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。

            2)核算當次實驗所需要的反應數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。

            n =陰性對照數(shù)(1T+陽性對照數(shù)(1T+誤差預留量(1T+樣本數(shù)

            單反液配制表(每份)

            RT-PCR反應液

            15.0 μL

            逆轉(zhuǎn)錄酶

             2.0 μL

            Taq

             3.0 μL

             (3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。

            2.樣本準備(樣本處理區(qū))

            QIAGENRoche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。

            3.加樣

            在上述制備好的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。

            4.PCRPCR擴增區(qū))

            1)取樣本處理區(qū)準備好的PCR反應管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。

            2)按下表設置儀器核酸擴增相關參數(shù)進行PCR擴增。

             

             

             

             

             

            反應體積

            25 μL

            通道選擇

            FAM通道采集PRV熒光信號

            PCR

            反應

            條件

            步驟

            條件

            循環(huán)數(shù)

            反轉(zhuǎn)錄

             4210分鐘(min

            1

            預變性

            953分鐘(min

            1

            預擴增

            955秒(s

            5

            5540秒(s

            PCR擴增

            955秒(s

            40

            5540秒(s

            (此階段結束時采集熒光信號)

            注:ABI系列熒光PCR儀在設置時不選ROX校正,設置淬滅基團選擇None

            【參考值(參考范圍)】

            1.試劑盒有效性判定:

            1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct≤35。

            2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。

            2.標本結果判定:

            1陽性:標本檢測結果Ct≤35或有明顯指數(shù)增長期。

            2)可疑:標本檢測結果Ct值在3538范圍內(nèi)。此時應對標本進行重復檢測,如重復實驗結果Ct值仍在3538范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。

            3)陰性:標本檢測結果Ct值>38或無Ct值。

            【檢驗結果的解釋】

            通道及檢測結果

            標本檢測結果解釋

            FAM

            陰性(-)

            標本中未檢出PRV RNA

            陽性(+)

            標本中檢測出PRV RNA

            【檢驗方法的局限性】

            1. 當檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的di檢出shi可能會發(fā)生假陰性的結果。

            2. 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中操作方式不當容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結果。

            3. 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽性結果。

            【產(chǎn)品性能指標】 產(chǎn)品的di檢出限為102 Copies/mL,產(chǎn)品CV≤5%。

            【注意事項】

            1. 整個檢測過程應嚴格按照本說明書要求分別在試劑準備區(qū)、樣本處理區(qū)和PCR擴增區(qū)進行操作,各區(qū)實驗服、儀器、耗材應獨立使用,不能混用;實驗用吸頭采用帶濾芯吸頭;樣本處理區(qū)應配有生物安全柜,樣本處理在生物安全柜中進行操作;三個區(qū)應該配有紫外線殺菌裝置。

            2. 為避免RNA降解,樣本處理過程應在0-4條件下操作,且完成實驗后立即上機檢測;樣本處理過程中使用的器具耗材應經(jīng)過無核酶處理。

            3. 每次實驗應該設置陰、陽性對照。

            4. 試劑盒所有試劑在使用前應該在常溫下充分融化混勻,并應瞬時離心。

            5. 試劑盒內(nèi)所配陰性和陽性對照在di一次使用前應全部轉(zhuǎn)移至標本準備區(qū),并單獨存放。

            6. 為防止熒光干擾,應避免裸手直接接觸PCR反應管,并應避免在PCR反應管上進行任何標記。

            7. 儀器擴增相關參數(shù)應按照本說明書相關要求進行設置;不同批號試劑不能混用。

            8. ABI系列熒光定量PCR儀參數(shù)設置中不選ROX校正,淬滅基因選擇None

            9. 實驗過程中產(chǎn)品的廢棄物應該進行無害化處理后方可丟棄。

             

             


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