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            豬流行性腹瀉病毒PCR檢測試劑盒說明書

            閱讀:1027          發(fā)布時間:2019-4-8
            提 供 商 上海臻科生物科技有限公司 資料大小 64.5KB
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            豬流行性腹瀉病毒PCR檢測試劑盒

             

            【產(chǎn)品名稱】

            通用名稱:豬流行性腹瀉病毒PCR檢測試劑盒(實時熒光PCR法)

            英文名稱Porcine epidemic diarrhea virus Detection Kit (Real-Time PCR Method)

            【包裝規(guī)格】 25T/盒 & 50T/盒

            【預期用途】

            本試劑盒利用實時熒光PCR原理,定性檢測豬流行性腹瀉病毒,對豬流行性腹瀉病毒引起的疾病診斷及療效評估有重要指導意義。

            【檢驗原理】

            本試劑盒針對豬流行性腹瀉病毒的高度保守區(qū)域設(shè)計特異性引物和探針,在反應(yīng)體系中含豬流行性腹瀉病毒基因組模板的情況下,PCR反應(yīng)得以進行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應(yīng)通道信號進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結(jié)果的定性分析。

            【主要組成成份】

            序號

            組成

            25T/盒

            50T/盒

            1

            PEDV RT-PCR反應(yīng)液

            375 μL×1管

            750 μL×1管

            2

              PEDV逆轉(zhuǎn)錄酶

             50 μL×1管

            100 μL×1管

            3

              PEDV Taq酶

             75 μL×1管

            150 μL×1管

            4

              PEDV陽性對照

             40 μL×1管

             40 μL×1管

            5

              PEDV陰性對照

             40 μL×1管

             40 μL×1管

            6

            說明書

            1份

            1份

            注:陰性對照為基因組DNA,陽性對照為失去活性的豬流行性腹瀉病毒cDNA。

            【儲存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。

            【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實時熒光定量PCR儀。

            【樣本要求】

            1. 適用標本類型:發(fā)病動物血液、空腸及小腸腸內(nèi)容物及組織臟器(腸道組織、腸系膜及淋巴結(jié)等)和病毒培養(yǎng)液。

            2. 標本采集,方法如下:

            (1) 血清:用一次性注射器取靜脈血2-3ml,轉(zhuǎn)至5ml 的干燥管中,密閉送檢。

            (2) 腸內(nèi)容物:無菌條件下取腸道內(nèi)容物約1g 左右,置入1ml 含有1.0ml PBS(或生理鹽水)5ml 離心管中,立即送檢。

            (3) 組織臟器:取發(fā)病動物腸道組織及腸系膜淋巴結(jié)等組織約1g,置一1.5ml的潔凈離心管中,密閉送檢。

            3.應(yīng)避免標本間交叉污染。

            4.標本收集后可立即檢測;若不能立即檢測,可置于28℃冷藏過夜保存;如需長期保存,標本應(yīng)凍存于-80以下,避免反復凍融。

            【檢驗方法】

            1. 試劑準備(試劑準備區(qū))

            (1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。

            (2)核算當次實驗所需要的反應(yīng)數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應(yīng)體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。

            n =陰性對照數(shù)(1T)+陽性對照數(shù)(1T)+誤差預留量(1T)+樣本數(shù)

            單反液配制表(每份)

            RT-PCR反應(yīng)液

            15.0 μL

            逆轉(zhuǎn)錄酶

             2.0 μL

            Taq

             3.0 μL

             (3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應(yīng)管。

            2.樣本準備(樣本處理區(qū))

            用QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。

            3.加樣

            在上述制備好的PCR反應(yīng)樣本管中分別加入處理好的待測標本RNA各5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。

            4. PCR(PCR擴增區(qū))

            (1)取樣本處理區(qū)準備好的PCR反應(yīng)管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應(yīng)位置,并記錄放置順序。

            (2)按下表設(shè)置儀器核酸擴增相關(guān)參數(shù)進行PCR擴增。

             

             

            反應(yīng)體積

            25 μL

            通道選擇

            FAM通道采集豬流行性腹瀉病毒熒光信號

            PCR

            反應(yīng)

            條件

            步驟

            條件

            循環(huán)數(shù)

            反轉(zhuǎn)錄

             42℃:10分鐘(min)

            1

            預變性

            95℃:3分鐘(min)

            1

            預擴增

            95℃:5秒(s)

            5

            55℃:40秒(s)

            PCR擴增

            95℃:5秒(s)

            40

            55℃:40秒(s)

            (此階段結(jié)束時采集熒光信號)

            注:ABI系列熒光PCR儀在設(shè)置時不選ROX校正,設(shè)置淬滅基團選擇None。

            【參考值(參考范圍)】

            1.試劑盒有效性判定:

            (1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct值≤35。

            (2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。

            2.標本結(jié)果判定:

            (1)陽性:標本檢測結(jié)果Ct值≤35或有明顯指數(shù)增長期。

            (2)可疑:標本檢測結(jié)果Ct值在35~38范圍內(nèi)。此時應(yīng)對標本進行重復檢測,如重復實驗結(jié)果Ct值仍在35~38范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。

            (3)陰性:標本檢測結(jié)果Ct值>38或無Ct值。

            【檢驗結(jié)果的解釋】

            通道及檢測結(jié)果

            標本檢測結(jié)果解釋

            FAM

            陽性(+)

            標本中檢出豬流行性腹瀉病毒RNA

            陰性(-)

            標本中未檢出豬流行性腹瀉病毒RNA

            【檢驗方法的局限性】

            • 當檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的低檢出*可能會發(fā)生假陰性的結(jié)果。
            • 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中操作方式不當容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結(jié)果。
            • 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽性結(jié)果。

            【產(chǎn)品性能指標】 產(chǎn)品的低檢出限為102 Copies/mL,產(chǎn)品CV值≤5%。

            【注意事項】

            • 整個檢測過程應(yīng)嚴格按照本說明書要求分別在試劑準備區(qū)、樣本處理區(qū)和PCR擴增區(qū)進行操作,各區(qū)實驗服、儀器、耗材應(yīng)獨立使用,不能混用;實驗用吸頭采用帶濾芯吸頭;樣本處理區(qū)應(yīng)配有生物安全柜,樣本處理在生物安全柜中進行操作;三個區(qū)應(yīng)該配有紫外線殺菌裝置。
            • 為避免RNA降解,樣本處理過程應(yīng)在0-4℃條件下操作,且完成實驗后立即上機檢測;樣本處理過程中使用的器具耗材應(yīng)經(jīng)過無核酶處理。
            • 每次實驗應(yīng)該設(shè)置陰、陽性對照。
            • 試劑盒所有試劑在使用前應(yīng)該在常溫下充分融化混勻,并應(yīng)瞬時離心。
            • 試劑盒內(nèi)所配陰性和陽性對照在di一次使用前應(yīng)全部轉(zhuǎn)移至標本準備區(qū),并單獨存放。
            • 為防止熒光干擾,應(yīng)避免裸手直接接觸PCR反應(yīng)管,并應(yīng)避免在PCR反應(yīng)管上進行任何標記。
            • 儀器擴增相關(guān)參數(shù)應(yīng)按照本說明書相關(guān)要求進行設(shè)置;不同批號試劑不能混用。
            • ABI系列熒光定量PCR儀參數(shù)設(shè)置中不選ROX校正,淬滅基因選擇None。
            • 實驗過程中產(chǎn)品的廢棄物應(yīng)該進行無害化處理后方可丟棄。

             

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