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當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>> BTP-S00106PLS-DA/OPLS-DA二維圖檢測技術服務
產(chǎn)品型號BTP-S00106
品 牌其他品牌
廠商性質其他
所 在 地北京市
更新時間:2023-09-26 16:07:37瀏覽次數(shù):147次
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不同于主成分分析(PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis(PLS-DA)或Orthogonal PLS-DA(OPLS-DA)是一種有監(jiān)督的判別分析統(tǒng)計方法。該方法運用PLS-DA建立代謝物表達量與樣品類別之間的關系模型,來實現(xiàn)對樣品類別的預測。分別建立兩兩分組比較的PLS-DA模型(圖1)或OPLS-DA模型(圖2),模型得到的參數(shù)評價會以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分別表示所建模型對X和Y矩陣的解釋率,Q2標示模型的預測能力,理論上R^2、Q^2數(shù)值越接近1說明模型越好,越低說明模型的擬合準確性越差,通常情況下,R^2、Q^2高于0.5(50%)較好,高于0.4即可接受,且兩者差值不應過大。臨床樣本由于個tǐ差異大,不可控,尤其大樣本時,R^2、Q^2大小為0.2左右亦可。圖3則是對PLS-DA模型(c)的檢驗,直線的斜率大,Q^2的截距為X,說明PLS-DA模型沒有過擬合。同時通過計算變量投影重要度(Variable Importance for the Projection, VIP)來衡量各代謝物的表達模式對各組樣本分類判別的影響強度和解釋能力,從而輔助標志代謝物的篩選(通常以VIP值>1.0作為篩選標準)(圖4)。
圖1 假手術組和模型組的PLS-DA 得分圖
圖2 假手術組和模型組的OPLS-DA模型
圖 3 PLS-DA模型的排列檢驗圖
圖 4 假手術組和模型組的PLS-DA 模型載荷圖
注:紅框所圈的點為VIP>1的代謝產(chǎn)物
PLS-DA/OPLS-DA二維圖檢測技術服務-詳情介紹
北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 簡稱BTP)從事以生物質譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(包括蛋白質、多肽、代謝物)質譜分析以及小分子物質檢測服務。
1、公司采用ISO9001質量控制體系,專業(yè)提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2、獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合quan |球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務;
3、業(yè)務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
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