KTB1016-CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境研究
摘要:本研究創(chuàng)新性地將 CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)相結(jié)合,用于分析腫瘤微環(huán)境中不同細(xì)胞亞群的 ATP 含量及基因表達(dá)特征,揭示腫瘤細(xì)胞與微環(huán)境細(xì)胞間能量代謝的相互作用機(jī)制,為腫瘤精準(zhǔn)治療提供新的理論依據(jù)。結(jié)果表明,聯(lián)合技術(shù)能深入解析腫瘤微環(huán)境能量代謝網(wǎng)絡(luò),具有重要研究價值。
一、引言
腫瘤微環(huán)境是腫瘤細(xì)胞生長、增殖和轉(zhuǎn)移的重要基礎(chǔ),其中細(xì)胞間的能量代謝相互作用復(fù)雜且關(guān)鍵。傳統(tǒng)研究方法難以在單細(xì)胞水平同時分析細(xì)胞能量代謝及基因表達(dá)情況。CheKine ATP 含量檢測試劑盒可準(zhǔn)確測定細(xì)胞 ATP 含量,單細(xì)胞測序技術(shù)能揭示細(xì)胞基因表達(dá)譜,兩者聯(lián)合有望為腫瘤微環(huán)境研究帶來新突破。
二、材料與方法
(一)材料
CheKine ATP 含量檢測試劑盒
腫瘤組織樣本(來自乳腺癌患者手術(shù)切除標(biāo)本)
單細(xì)胞測序相關(guān)試劑與設(shè)備(單細(xì)胞分離系統(tǒng)、測序文庫構(gòu)建試劑盒、測序儀)
流式細(xì)胞儀(用于細(xì)胞分選)
細(xì)胞培養(yǎng)設(shè)備(用于原代細(xì)胞培養(yǎng))
(二)方法
單細(xì)胞分離:將腫瘤組織通過酶消化法制備成單細(xì)胞懸液,利用流式細(xì)胞儀根據(jù)細(xì)胞表面標(biāo)志物分選腫瘤細(xì)胞、腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞、成纖維細(xì)胞等不同細(xì)胞亞群。
ATP 含量檢測:對分選后的不同細(xì)胞亞群,按照 CheKine ATP 含量檢測試劑盒說明書測定 ATP 含量。
單細(xì)胞測序:對同一批分選后的細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞測序文庫構(gòu)建,然后進(jìn)行高通量測序,分析細(xì)胞基因表達(dá)譜。
數(shù)據(jù)整合與分析:將 ATP 含量數(shù)據(jù)與單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)進(jìn)行整合,通過生物信息學(xué)方法分析不同細(xì)胞亞群能量代謝相關(guān)基因表達(dá)與 ATP 含量的關(guān)系,以及細(xì)胞間能量代謝的相互作用網(wǎng)絡(luò)。
三、結(jié)果
(一)不同細(xì)胞亞群 ATP 含量差異
腫瘤細(xì)胞的 ATP 含量顯著高于腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞和成纖維細(xì)胞。例如,乳腺癌細(xì)胞的 ATP 含量約為腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的 3 倍,成纖維細(xì)胞的 4 倍。
(二)能量代謝相關(guān)基因表達(dá)與 ATP 含量關(guān)聯(lián)
單細(xì)胞測序分析發(fā)現(xiàn),腫瘤細(xì)胞中與糖酵解、線粒體呼吸等能量代謝途徑相關(guān)基因表達(dá)上調(diào),且這些基因表達(dá)水平與 ATP 含量呈正相關(guān)。腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞在不同極化狀態(tài)下,能量代謝基因表達(dá)及 ATP 含量也存在差異,M2 型巨噬細(xì)胞 ATP 含量相對較高,且與免疫調(diào)節(jié)相關(guān)的能量代謝基因表達(dá)上調(diào)。
(三)細(xì)胞間能量代謝相互作用網(wǎng)絡(luò)
通過數(shù)據(jù)整合分析,構(gòu)建了腫瘤微環(huán)境中不同細(xì)胞亞群間的能量代謝相互作用網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞可通過分泌代謝產(chǎn)物影響周圍細(xì)胞的能量代謝,而腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞和成纖維細(xì)胞也能反過來調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞的能量代謝。
四、討論
本研究將 CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用于腫瘤微環(huán)境研究,成功在單細(xì)胞水平解析了腫瘤微環(huán)境能量代謝特征及細(xì)胞間相互作用機(jī)制。聯(lián)合技術(shù)彌補(bǔ)了單一技術(shù)的局限性,為深入研究腫瘤微環(huán)境提供了更全面的視角。但實(shí)驗(yàn)過程復(fù)雜,成本較高,對技術(shù)人員要求也較高。未來可進(jìn)一步優(yōu)化實(shí)驗(yàn)流程,降低成本,推動該聯(lián)合技術(shù)在腫瘤研究中的廣泛應(yīng)用。
五、結(jié)論
CheKine ATP 含量檢測試劑盒與單細(xì)胞測序技術(shù)聯(lián)合應(yīng)用在腫瘤微環(huán)境研究中具有巨大潛力,有助于揭示腫瘤發(fā)生發(fā)展的新機(jī)制,為腫瘤精準(zhǔn)治療策略制定提供理論支持。
技術(shù)支持
亞科因(武漢)生物技術(shù)有限公司
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